El principi del procés MBBR és augmentar la biomassa i les espècies al reactor afegint una certa quantitat de transportador de suspensió al reactor, per tal de millorar l'eficiència del tractament del reactor. Com que la densitat del farciment és propera a la de l'aigua, es barreja completament amb aigua durant l'aireació i l'entorn per al creixement microbià és gasós, líquid i sòlid. L'efecte de col·lisió i cisalla del portador a l'aigua fa que les bombolles d'aire siguin més fines i augmenta la taxa d'utilització d'oxigen. A més, cada portador té diferents espècies biològiques dins i fora, alguns bacteris anaeròbics o bacteris facultatius creixen a l'interior i l'exterior són bons bacteris tròfics, de manera que cada portador és un reactor en miniatura, de manera que la reacció de nitrificació i la reacció de desnitrificació existeixen alhora. temps, per millorar l'efecte del tractament.
