La idea bàsica de disseny de l'MBBR és poder funcionar contínuament, sense obstruccions, sense rentat a contracor, amb baixa pèrdua de càrrega i una gran superfície específica. Això es pot aconseguir mitjançant el creixement del biofilm en unitats portadores més petites, que es mouen lliurement amb el flux d'aigua al reactor. En els reactors aeròbics, el portador es mou per aireació, i en els reactors anòxics/anaeròbics, el portador es mou per agitació mecànica. Per evitar la pèrdua de material d'embalatge al reactor, es pot instal·lar un filtre porós a la sortida del reactor (Fig. 1). Els MBBR són generalment de forma rectangular o cilíndrica. El reactor rectangular es divideix uniformement en diversos o cap compartiments amb particions al llarg del dipòsit. En general, el flux d'aigua es troba en estat de flux d'empenta al reactor, mentre que a cada cel·la, el flux d'aigua està completament barrejat a causa de la fluidització de l'aireació. El dipòsit s'omple amb un embalatge de suspensió de polietilè o polipropilè amb una gravetat específica propera a l'aigua i una gran superfície específica, i la superfície de fixació del biofilm al reactor pot arribar als 500 m2/m3 i la superfície específica real (superfície interior del farciment) és de 350 m2/m3. El tub d'aireació perforat s'aireja per un costat per fer circular l'embalatge pel dipòsit. La part inferior del reactor cilíndric està equipada amb un capçal d'aireació microporós. A més, alguns reactors no només estan equipats amb un dispositiu d'aireació a la part inferior del dipòsit, sinó també amb un dispositiu d'agitació. Aquests dispositius d'agitació permeten utilitzar el reactor de manera fàcil i flexible en condicions anòxiques. De vegades, per tal d'evitar l'eliminació de l'aire i la volatilització causada per l'aireació, es pot afegir una tapa a sobre del reactor.
Als països estrangers, el MBBR s'ha utilitzat per realitzar estudis a petita escala, pilot i productius sobre el tractament d'aigües residuals domèstiques i algunes aigües residuals industrials, i s'han obtingut bons resultats. Els resultats de la prova mostren que el procés de tractament d'aigües residuals de biofilm de llit mòbil és adequat per al tractament d'aigües residuals domèstiques mitjanes i petites i aigües residuals orgàniques industrials. Entre ells, els dispositius de tractament d'aigües residuals integrats o enterrats tenen bones perspectives de promoció i aplicació a la Xina. Tanmateix, encara hi ha alguns problemes amb els reactors de biofilm de llit mòbil, com ara el moviment desigual del material d'embalatge al reactor i diferents graus de zones mortes al tanc. Com millorar les característiques del flux hidràulic al reactor i reduir el consum d'energia operativa és un problema digne de discussió en profunditat en el desenvolupament de reactors de biofilm de llit mòbil. El funcionament de MBBR de la mateixa manera que SBR és una millora de la tecnologia MBBR, que s'anomena Moving.Bed Sequencing BatchBiofilm Reactor (MBSBBR), que té els avantatges tant de MBBR com de SBR. Una altra millora és fer circular el material d'embalatge amb el flux d'aigua al reactor, que s'anomena reactor de biofilm portador mòbil cíclic, que té els avantatges tant del MBBR com dels reactors de circulació interna.